復合碳源過促進聚磷菌和反硝化聚磷菌在厭氧、好氧交替狀態下迅速生長, 使其好氧吸磷量大大超過厭氧釋磷量, 即增強微生物對磷的內吸收, 并在好氧末端通過對富磷污泥的排放, 達到除磷的效果。 反硝化菌是屬于異養型兼性厭氧菌, 在缺氧的條件下以 NOx-N 電子受體, 以有機物為電子供體, 反硝化菌利用碳源將亞硝酸鹽氨, 硝酸鹽氮還原成氣態氨(N2). 復合碳源作為有機物為電子供本, 可有效的給反硝化菌提供能量, 加強反硝化反應進行脫氮。