按照能否被微生物快速利用分類快速碳源：來的快，去的也快的碳源，能較快被微生物利用，如葡萄糖、當地紅糖、同城蜂蜜等。微生物能迅速吸收這些物質，進行細胞代謝和生長繁殖活動。緩釋碳源或長效碳源：作用緩慢但持續時間較長的碳源。像淀粉、附近谷物粉、當地小米粉等大分子有機物屬于此類。由于一些微生物不能直接利用大分子物質，需要先把它們分解成小分子才能被其他微生物利用，這個分解過程消耗能量，所以其作用發揮相對緩慢.（三）按照生產方式分類發酵碳源：通過發酵的方式獲得的碳源。例如利用生物工程原理，對糖類、當地農產品廢料等發酵生產出的生物質碳源。普通碳源（或傳統碳源）：包括化學合成碳源、本地提取碳源和純化碳源，如一些化工合成的小分子有機酸、醇類或者直接從自然資源中提取和純化得到的單一有效成分的碳源等。